长期不在一起的夫妻，婚姻关系不会自动终止。依据《婚姻法》，解除婚姻需协议或诉讼，不存在自动离婚。长期分居虽为感情破裂情形，但不直接导致离婚。
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夫妻长期分居不等同离婚。处理方式：1.协议离婚，需双方同意并签订离婚协议，到民政局办理；2.诉讼离婚，一方不同意时，另一方可向法院起诉，由法院判决。
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夫妻长期不在一起，解除婚姻关系的常见方式为协议离婚或诉讼离婚。若双方能协商一致，可选择协议离婚；若协商不成，则需通过诉讼离婚来解决。